El primer precedente hay que localizarlo la temporada 1940 - 1941. Se jugó entonces la denominada Copa de Campeones entre el campeón de Liga (Atlético Aviación) y el de Copa (RCD Espanyol). Después de un empate a tres en Barcelona, el equipo madrileño barrió al catalán en la capital: 7-1. Fue una manera, entonces, de homenajear a los dos campeones nacionales, pero no tuvo continuidad.
La Supercopa volvió al calendario la campaña 1945 - 1946, ahora bajo la denominación Copa de Oro Argentina y con carácter benéfico. Se llamó así porque fue una iniciativa del cónsul argentino en Barcelona, que repartió la recaudación de los dos partidos a distintos hospitales de Barcelona y Bilbao. A diferencia del anterior precedente se jugó a partido único (en Les Corts el 23 de diciembre de 1945) y lo ganó el Barça (campeón de Liga) al Athletic Club (campeón de Copa) por 5-4.
Tampoco tuvo continuidad la Copa de Oro, aunque ahora, la Federación Española, viendo que la competición tenía su interés, entró en escena y la reactivó la temporada 1947 - 1948 bajo el nombre Copa Eva María Duarte de Perón, en honor a la esposa del entonces presidente argentino Juan Domingo Perón, que había ayudado a una necesitada España donando carne y trigo en la complicada y oscura época de las postguerra.
El primer título fue para el Real Madrid, campeón de Copa, que se impuso al Valencia, campeón de Liga, en Chamartín 3:1 en la prórroga. Era el 13 de junio de 1948. La siguiente edición se jugó, a diferencia de la primera, a finales del mismo año, el 19 de diciembre de 1948 y enfrentó al FC Barcelona contra el Sevilla en Mestalla: Ganaron los catalanes 1-0.
La temporada 1949 - 1950 el FC Barcelona, campeón de Liga, dobló la rodilla ante el Valencia, campeón de Copa, en el Metropolitano madrileño. Era el 12 de octubre de 1949: 7-4 (hubo prórroga).
En el ejercicio siguiente, 1950 - 1951, los contendientes fueron el Atlético de Madrid (campeón de Liga) y el Athletic Club (campeón de Copa). El primer envite acabó 5-5 después de la prórroga y, como por aquel entonces no se estilaba la definición por penaltis, se jugó un segundo partido, también en Chamartín, que ganaron los bilbaínos por 2-0.
La última edición que se jugó tuvo lugar la temporada 1951 - 1952 y la jugaron el Atlético de Madrid (campeón de Liga) y el FC Barcelona (campeón de Copa). Ganaron los madrileños por 2-0.
Pero al FC Barcelona le cabe el honor de ganar las dos últimas ediciones de esta competición, que se adjudicó sin lucha por haberse proclamado campeón de Liga y Copa las temporadas 1952 - 1953 y 1953 - 1954. A partir de ahí, el desierto. Hasta que Núñez reactivó un trofeo que, hoy en día, es uno de los primeros en dirimirse. Un apunte: en 1996 la Federación acordó que, para que no se repitieran las situaciones dadas en 1984 y 1989, en la que no se disputó por el doblete del Athletic Club y el Real Madrid, los subcampeones de Copa fueran el rival del campeón de Liga. Así, en 1996, 1998 y 2009, el FC Barcelona, Mallorca y Athletic Club jugaron la competición en calidad de subcampeones del torneo del KO.
Palmarés
1940 - 1941: Atlético Aviación (Copa de Campeones)
1945 - 1946: FC Barcelona (Copa de Oro Argentina)
1947 - 1948: Real Madrid (Copa Eva María Duarte de Perón)
1948 - 1949: FC Barcelona
1949 - 1950: Valencia
1950 - 1951: Athletic Club
1951 - 1952: Atlético Madrid
1952 - 1953: FC Barcelona (sin lucha)
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1953 - 1954: FC Barcelona (sin lucha)